Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa13Q62424 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa13Q62424 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms