Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddr2Q62371 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddr2Q62371 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms