Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd1Q61466 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd1Q61466 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms