Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd2Q61285 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd2Q61285 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd2Q61285 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms