Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn18Q61152 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn18Q61152 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn18Q61152 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn18Q61152 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms