Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf8Q60846 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf8Q60846 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 321.1 ms