Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3Q60803 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms