Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpdQ60668 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HnrnpdQ60668 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HnrnpdQ60668 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms