Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm1Q60636 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms