Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arhgap44Q5SSM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap44Q5SSM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap44Q5SSM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms