Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mdc1Q5PSV9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms