Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Scarf1Q5ND28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scarf1Q5ND28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms