Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UrgcpQ5NCI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368.6 ms