Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms