Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH6

Spdye4a, Speedy protein E4A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4aQ5IBH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdye4aQ5IBH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spdye4aQ5IBH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms