Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rtl5Q5DTT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rtl5Q5DTT4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms