Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmoQ562D6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrmoQ562D6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrmoQ562D6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms