Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc3lQ4KL14 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms