Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shank3Q4ACU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shank3Q4ACU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms