Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxn3Q499D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxn3Q499D0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms