Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pls1Q3V0K9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pls1Q3V0K9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls1Q3V0K9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pls1Q3V0K9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pls1Q3V0K9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms