Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bbof1Q3V079 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms