Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTC0

B020004J07Rik, RIKEN cDNA B020004J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004J07RikQ3UTC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B020004J07RikQ3UTC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020004J07RikQ3UTC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms