Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec31aQ3UPL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sec31aQ3UPL0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms