Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrp36Q3UFY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp36Q3UFY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms