Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr41Q3UDP0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr41Q3UDP0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms