Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dennd1bQ3U1T9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dennd1bQ3U1T9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dennd1bQ3U1T9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dennd1bQ3U1T9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.9 ms