Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U1D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U1D9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U1D9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U1D9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U1D9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms