Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
March9Q3TZ87 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March9Q3TZ87 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March9Q3TZ87 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms