Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf6Q3TWW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srsf6Q3TWW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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