Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrx1Q3TL44 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrx1Q3TL44 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms