Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms