Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ptchd1Q14B62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ptchd1Q14B62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ptchd1Q14B62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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