Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prok1Q14A28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prok1Q14A28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prok1Q14A28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms