Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa6Q0VGU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa6Q0VGU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa6Q0VGU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms