Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VgfQ0VGU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms