Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc138Q0VF22 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms