Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntnap5aQ0V8T9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms