Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfdp1Q08639 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tfdp1Q08639 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms