Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnma1Q08460 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms