Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a2Q07643 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a2Q07643 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms