Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col17a1Q07563 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col17a1Q07563 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Col17a1Q07563 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col17a1Q07563 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms