Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sdr16c6Q05A13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdr16c6Q05A13 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdr16c6Q05A13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdr16c6Q05A13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 669 ms