Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fmn1Q05860 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fmn1Q05860 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fmn1Q05860 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Fmn1Q05860 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms