Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sox12Q04890 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sox12Q04890 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sox12Q04890 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms