Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn6Q03958 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfdn6Q03958 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms