Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddr1Q03146 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddr1Q03146 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms