Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Apba2P98084 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apba2P98084 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apba2P98084 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apba2P98084 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apba2P98084 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apba2P98084 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Apba2P98084 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms