Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VegfdP97946 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VegfdP97946 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfdP97946 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfdP97946 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VegfdP97946 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VegfdP97946 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms