Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tarbp2P97473 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms