Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frg1P97376 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frg1P97376 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frg1P97376 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frg1P97376 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frg1P97376 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frg1P97376 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frg1P97376 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms